精子畸形率99%一般情况下是可以治好的，患者需要先去医院进行检查，明确病因，在进行对症治疗。

1、不良生活习惯。如果患者存在吸烟、饮酒等不良习惯，香烟中的尼古丁以及白酒中的酒精就会刺激精子，使其出现畸形症状，所以患者需要及时戒烟、戒酒。

2、生殖系统炎症。如果患者出现前列腺炎、睾丸炎等生殖系统炎症，都可以导致睾丸损伤，导致患者出现精子畸形率99%的现象。该患者需要遵医嘱服用阿莫西林、氧氟沙星来进行抗感染治疗。

3、环境因素。如果患者长期接触辐射、化学物质，就容易导致精子畸形，使患者出现精子畸形率99%的现象。如果是这种情况，建议患者尽量避免接触辐射、化学物质，如果无法避免，可以穿戴防护服。